O Instituto Refloresta acredita na construção de um mundo onde as florestas sejam vistas como parte fundamental na composição da Terra e que possam inspirar a humanidade a existir, diversa e harmoniosamente, praticando a sabedoria e o respeito entre todas as formas de vida em busca da sustentabilidade.

A Ecoar Florestal teve a sua origem no Programa Florestal do Instituto Ecoar para a Cidadania (Ong fundada por ativistas ambientais, logo após a Conferência Rio 92). Em 1996, constatou-se que aquele Programa Florestal já possuía uma dimensão e características próprias que justificariam a criação de uma entidade capaz de abrigar um trabalho mais focado em questões da conservação, restauração, reposição e produção florestal. Deu-se então a criação Associação Ecoar Florestal.

Ao longo dos anos a Associação Ecoar Florestal e Instituto Ecoar para a Cidadania atuaram de maneira bastante próxima, compartilhando objetivos e trabalhando em estreita parceria no desenvolvimento de vários projetos e programas.

Em 2010 a Associação Ecoar Florestal passou a adotar o nome fantasia Instituto Refloresta, procurando, com isso, criar e fortalecer uma identidade própria; ao mesmo tempo, mantém seus princípios originais, mas sempre disposta a transformar-se continuamente a fim de ampliar e aprofundar seus trabalhos.

Atualmente o Instituto Refloresta conta com a atuação de 26 pessoas em sua equipe. São agrônomos, engenheiros florestais, educadores, técnicos agrícolas e florestais, viveiristas, coletores de sementes, administrativos e estagiários que atuam nos 5 Núcleos, localizados nas cidades de São Paulo (sede), Pilar do Sul, Capão Bonito, Porto Feliz e Ibiúna.